就在孫燦跟隨劉華研習兵書之即，也正是天下大亂之時。
孝靈皇帝中平元年。
大漢的形勢更加的惡劣了，飢餓的農民忍無可忍，終於爆發了全面反抗，其中規模最大的隊伍便是由張角三兄弟所領導的黃巾起義了。
張角本是冀州鉅鹿縣人，他有兩個兄弟，老二張寶，及老三張梁。
那張角本是個不第秀才，因入山採藥之時，偶遇一老人，碧眼童顏，手執藜杖，此人正是南華老仙，因感悟天下蒼生，特地在此傳授有緣人《太平要術》希望他造福世人，而張角這次就幸運的成為了這個有緣之人。
張角本來就對民間醫術很有研究，得到《太平要術》後，相當於虎生雙翼，不久便習得了一身高明的醫術。
只是這兄弟幾人卻意欲圖謀不軌，藉以給人治病為由，以「太平道」的宗教形式，愚弄群眾。大約十年左右的光景，太平道教便幾乎是傳遍了整個天下，其中尤以青州、徐州、幽州、冀州、荊州、揚州、兗州，豫州等八個州為最，教徒更是多達幾十萬人之多。
隨後張角弟兄三人又在大漢範圍內設置了三十六方，大方一萬多人，小方六七千人，每方各設渠帥負責。
為了方便起誓，他們還傳出了四句口訣，作為內部的暗號。這四句口訣就是：「蒼天已死，黃天當立；歲在甲子，天下大吉。」
甲子就是漢靈帝中和元年，即公元一八四年。
在二月的月初，各方首領及信徒便已著手準備。他們用石灰在洛陽的城門及州郡官府牆上書寫「甲子」等標語口號。
這其中一大方的渠帥馬元義首先通知了荊州和揚州的信徒大約數萬人，邀其到鄴城集中，準備起義。於是，其分管的信徒們便已開始向鄴城集中。
可是，就在這個緊急關頭，張角的弟子、太平道中的的一個信徒、濟南人唐周由於害怕失敗被抓就向當地的官府告發了起義之事。
消息一經傳開，朝野振蕩，靈帝當庭大怒。於是，朝廷眾臣緊急下令抓捕馬元義，車裂於洛陽；並緊急招集各方力量，追拿誅殺了張角的信徒一千餘人；又通知冀州捕捉張角兄弟及其家人。
張角等人發現事情已經敗露了，便即用各種方法星夜通知各方，立即起義。起義前，義軍首先將抓獲的貪官殺了祭天。起義時，張角軍皆頭裹黃巾（黃天的象徵），時人稱之「黃巾軍」。起義後，張角依據《太平經》中關於「有天治、有地治、有人治，三氣極，然後歧行萬物治也」的理論，自稱「天公將軍」，其弟張寶自稱地公將軍，其弟張梁自稱「人公將軍」。
不出幾天功夫，三十六方的黃巾軍便開始了一系列攻打郡縣，火燒官府，釋放囚犯，沒收官家的財物，開放糧倉，懲辦贓官、土豪等的舉動。不到十天的功夫，天下響應。青、徐、幽、冀、荊、揚、兗、豫八個州的郡守、刺史紛紛向京師告急，漢靈帝亦急的如同熱鍋上的螞蟻。
經過協商，在臨近洛陽的八個緊要的關口都設置了都尉，增加了洛陽的防禦。朝廷也分派出兩路軍隊去鎮壓起義的農民。
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而這一切都和孫燦無關，雖然孫燦很想隨軍出戰，但孫哲、劉華並沒有同意。理由有二：孫哲是以孫燦的年齡還小為由；而劉華則是以學業並未精通來勸說的。
在劉華看來，「黃巾之亂」只是一個契機，是屬於可有可無的，而真正的發家時刻卻是在十八路諸侯討董的時候。
孫燦面對父親和恩師的勸說，也只能壓下蠢蠢欲動的心情。除了陪伴太子劉辯學習以外，剩下的時間就只是學習兵法和武藝了。
在這期間，他也曾經多次尋找那位女子的下落，最後都是一無所獲。為了減少對那位女子的思念，孫燦惟有將心全都放在了學習兵法上。
另一邊，大漢軍的首戰並未得利，於同年四月，朱雋所統領的軍隊就被黃巾軍波才的隊伍所敗而撤退，皇甫嵩唯有與他一起進駐長社防守，被波才所率領的大軍圍困在城中，漢軍人數較少，士氣比較低落。
而汝南的黃巾軍又在邵陵打敗邵陵太守趙謙，廣陽的黃巾軍亦殺死了幽州刺史郭勳及太守劉衛，黃巾軍並未因漢室所採取的動作而有敗退的跡象，反而大有一統天下的氣勢。
同年五月，京師見皇甫嵩被圍，便指派曹操率軍救援，不過援軍未到時，皇甫嵩便已心生一計，在傍晚時份吹起大風，皇甫嵩命士兵手持火把暗暗出城，利用黃巾軍營寨周圍所生長的雜草，用火攻大破敵人，城上的軍隊亦舉出火把響應，皇甫嵩以鼓助戰，衝入敵陣，黃巾軍大亂，四處奔走。又遇上曹操的援軍，被皇甫嵩、朱雋和曹操三面夾擊，斬殺數萬人，漢軍終獲大勝。
六月，南陽太守秦頡與張曼成戰鬥，斬殺了張曼成。
喜訊傳至洛陽，洛陽上下一片歡騰。
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洛陽皇城潛心殿中
時年八歲的劉辯，正在庭院裡玩弄著孫燦帶給他是新鮮玩具－－彈弓。這玩意要想練成可不容易，劉辯打來打去也沒有一次打的中目標，頓時覺得有些掃興。他見孫燦正在院裡看著書，就不由自主的倔起了嘴巴。
要是以往，孫燦會在第一時間內和他玩耍。可是自從他迷上兵法後，就不怎麼理會他了。雖然還是跟以前一樣，每次入宮的時候，都會帶些宮外的美食和小巧的玩具，但卻很少在和他一起玩了，就算是玩的時候也是心不在焉。
有一次，劉辯死纏著孫燦要玩躲貓貓。孫燦被纏的無奈就點頭同意了。劉辯高興的躲在一個隱蔽的地方，這一躲就是半個時辰。
原先，劉辯以為是自己藏的地方太妙了，孫燦找不到。
這個傢伙玩遊戲，從來沒有贏過孫燦，這回的小小勝利實在是讓他非常高興。
可是，當他自己走出來的時候，頓時就傻眼了。孫燦哪裡也沒有去找，就一直在庭院裡看著兵書，一動也沒有動過。
原來，孫燦在等劉辯躲的時候，無聊就拿起了劉華的《孫子兵法》看了起來，這一看就忘記了一切，白白的放了劉辯半個時辰的鴿子，氣的劉辯幾乎發狂。
他來到孫燦的身旁，不滿的說道：「孫大哥，先別看了，你先教教我嘛，我怎麼打也打不準啊。」
孫燦只得放下兵書，從劉辯手中接過彈弓和胚土做成的泥丸，道：「彈弓是沒有準星的，但可以估量出，左手握緊彈弓架平舉，右手平拉，眼睛盯住皮筋的中心和彈弓架的中心，把中心點對準你要打的地方鬆開右手就行了，注意拉緊皮筋的時候皮筋要成一個長度相等的的三角圖形。接著就，放！」放字出口，一顆泥丸正中三米開外的，臥在池塘中蘆葦上的一隻小蜻蜓。
孫燦將彈弓還給了劉辯，道：「玩這個主要是依靠經驗的，只要練習的時間長了你就自然能百發百中了。」說完後，又拿起了兵書，認真的看了起來。
劉辯不滿道：「孫大哥，你也一起來玩嘛！這些兵書有什麼好看的啊，又沒有什麼用處。」
孫燦笑道：「怎麼沒有什麼用處，兵書上所寫的字字都是前輩先人所總結的精華篇章，若能通曉兵法，便可上陣殺敵，保衛國家。日後我也要向衛青、霍去病一樣，振興大漢，揚我國威。」
「呵呵，說得好！」