就在明石元二郎大張旗鼓地圍剿金正明的同時，中國國防軍海軍艦隊卻悄悄地向日本本土逼近。這支艦隊對於近代中國海軍來說可謂盛況空前，該艦隊的第一份艦隊由重生的八大遠——定遠、鎮遠、經遠、來遠、致遠、靖遠、濟遠、平遠八艘排水量一萬二千噸的裝甲巡洋艦擔任；第二分艦隊由整修完畢的北京號（原周防號）、天津號（原石見號）、上海號（原丹後號）、重慶號（原磐手號）、瀋陽號（原八雲號）、南京號（常磐號）擔綱；第三分艦隊則有原來的海圻號、海天號以及、飛鴻,龍湍,鯨波,應瑞,肇和,永豐,新穎、新鞏、永績、永建、鷹龍、鷹虎組成。加上新近投入戰鬥的小型航母秦始皇號和扶蘇號，在海上也算是浩浩蕩蕩了。
佐世保港，是現代日本最重要海港之一，位於日本九州島西北岸，為黃海與日本海間交通要衝，撫朝鮮海峽咽喉，是日本通向亞州大陸的前進基地。但以前只是一個荒村，直到清政府開始修建旅順口後，視北洋為心腹大患的日本政府才在這裡設海軍鎮守府，後又經過數次大規模擴建，已經成為了能和橫須賀港相媲美的日本最好的海軍基地之一。構築成了日本人心中既可以面向太平洋，又可以迅速在支援遠東戰區的最重要基地。
只可惜碼頭上有些清冷，主要是因為聯合艦隊沒有在此停泊，只剩下了幾艘巡邏艇和貨輪。只有幾處燈塔的火光還在通宵達旦的亮著，海軍港口內有幾支較小的魚雷艇尚在在水道外面巡邏，不時有海岸巡邏隊在港口的碼頭或彈藥庫的道路上查夜巡邏。
轟隆隆
轟隆隆
一團團巨大的火球首先從炮口位置奔騰而起，新式裝甲巡洋艦283毫米的主炮開始怒吼，看似牢不可破的炮台工事，在鋪天蓋地的炮火中，沒挨幾下就開始垮塌。數百個炮彈在夜色下同時爆炸，就如同數百朵雪白的蓮花在佐世保的港口中綻放，爆炸開的火焰又似山崩海嘯。一些暗堡下的日軍根本不知道到底發生了什麼事，他們手忙腳亂地用機槍、步槍胡亂設計，卻連敵人在哪裡都不知道。
持續三十分鐘的炮擊，終於把佐世保港堅固的大門撕裂了一道細縫，剩下要做的就是不斷地把細縫不斷撕裂，直真艦隊可以暢通無阻。此刻日軍岸炮已經全毀，只剩下一些移動小炮還在反抗，其說他們是在攻擊，不如說實在給中國艦隊表明方位。
應瑞,肇和,永豐,新穎、新鞏等幾艘輕型艦船在八大遠火力的掩護下殺進了佐世保軍港。通過水道後，佐世保軍港就猶如脫光了衣服的女人般露出了最肥美的身軀，岸邊依舊在抵抗的士兵們只能無奈的拿起步槍，密集的子彈打得艦殼叮噹作響。應瑞號上的小口徑速射炮立刻開火，一道道火蛇如肆虐的風暴，數以百計的士兵被炮彈攔腰截斷，到處是殘肢斷臂，鮮血沿著小溝，匯聚到海灣上，形成了一道道猩紅的血流。
整個佐世保基地就變得狼藉不堪，士兵抱著頭亂跑亂叫，建築物在火焰中化為灰燼，倉庫成了一堆堆碎石瓦礫，燃起的熊熊大火遮蔽了整個海港，到處都是殘垣斷壁，殘缺不全的屍體甚至鋪滿了整個碼頭附近的海面。
轟轟轟
轟轟轟
當幾聲巨大的爆炸聲接連響起，紫黑色的蘑菇雲沖天而起後，儲存了大量彈藥的海軍軍火庫終於爆炸了，接連不斷的爆炸聲如炒豆子般密集而又動聽，整個佐世保軍港都籠罩在了火海之中。
隨後，中國海軍又摧毀了佐世保造船的船塢和平台，所有大型、有價值的目標已經被摧毀殆盡之後，指揮這次行動的海軍司令程璧光才下令所有艦隊調轉航向。不過，他們不是返航，而是撲向下一個目標——吳港。
日本在吳港建設有新式槍炮兵工廠和煉鋼廠以及基本建成的大型維修船塢，吳港因此成為日本的一處秘密軍艦改裝基地，同時，日本政府引進了大量英國的造船技術和設備，船塢也比較多，是甲午黃海海戰後日本軍艦的主要維修基地，也是日本海軍很快又投入到威海衛戰爭當中的重要原因，後期更成為了日本海軍的潛艇基地一直沿用到今天。
此時的吳港一片寧靜，所有的港口、船廠員工甚至是留守的日本警備都沒有意識到死亡的降臨。隨著程璧光一聲令下，各艦的主炮一齊開火，只見一朵朵的小蘑菇雲，騰空而起，停泊在港內的三艘練習炮艦直接中彈沉沒。其他的小船更是一炮一艘。這讓水兵們十分過癮。緊接著便是各艦的速射炮副炮開火進行覆蓋式的攻擊，整個吳港剎那間就便成了地獄般的火海！
一天之內，日本本土兩處重要的軍事基地遭到毀滅性破壞。世界各國主流媒體紛紛報道了這則消息。世界輿論嘩然，日本人拚命否認，而中國則大肆宣揚，國內民眾歡呼雀躍，賽過過年。
海軍大臣八代六郎向日本海軍之父山本權兵衛求助，陸軍大臣岡市之助則向日本陸軍之父山縣有朋求招。而那個一直以正統天皇自居的熊澤天皇又帶著大批擁護者上街遊行示威，要求現任天皇下台。總之，就在明石元二郎信心滿滿地要重演甲午年那一幕時，日本本土正鬧得不可開交。