1915年8月10日上午，王士珍與垂頭喪氣的段祺瑞在袁世凱的府邸外面見到了。光看段祺瑞的表情就能猜到段祺瑞與徐世昌去哀求各國公使的努力完全失敗了。
見到王士珍，段祺瑞意氣消沉的上前問道：「老哥，大總統怎麼樣了？」
「昨天大總統醒來的時候，徐總理推薦自己的弟弟給大總統治病，大總統給嚴詞拒絕了。」王士珍語氣平淡的答道。
段祺瑞可沒有王士珍這麼好涵養，他的臉色變得更加難看了。沒等段祺瑞發作出來，王士珍繼續說道：「聽說袁家的人有人要用西醫，有人要用中醫，已經吵了幾天。」
這兩個消息段祺瑞倒也都稍微聽說過一些，他原本以為是道聽途說，直到王士珍親自證實了這兩個情報，段祺瑞的臉色灰暗起來。他這幾天低聲下氣的去聯繫各國公使，沒等段祺瑞求救，各國公使就聲色俱厲的先是呵斥北洋的無能，接著要求北洋軍竭盡全力先保護公使區的安全。好不容易等到段祺瑞談及向各國求救的事情，公使們本來就極為難看的臉色就變得更加難看起來。他們立刻毫不留情的拒絕了段祺瑞的請求。
王士珍見到段祺瑞忍不住喃喃的說了些什麼，他隱約聽了個大概，段祺瑞好像說了「群龍無首」四個字。
見到段祺瑞既沒有大罵袁家子弟的沒用，王士珍心裡面已經有了點譜。他對段祺瑞說道：「芝泉，我想讓你辦件事。」
「老哥有什麼吩咐。」段祺瑞素來尊敬王士珍，特別是在此時，王士珍肯定要吩咐重要的事情。
王士珍反倒遲疑了一下，段祺瑞可不是什麼傻瓜，有些話只要說出來，段祺瑞絕對能夠明白其中的意思。所以王士珍不得不斟酌一下才說道：「芝泉，城裡面亂成這樣，我想讓你派靠得住的部隊，好好守住國家大圖書館，國家博物院，國家資料館，還有皇宮。決不允許有人趁火打劫。特別是文物典籍，絕對不能讓它們出事。」
段祺瑞果然如同王士珍所料，最初對這個命令感到意外，很快段祺瑞的眉頭就皺了起來，他左右看看，乾脆把王士珍拉到了自己的馬車裡面。確定外面沒人能聽到，段祺瑞焦慮的說道：「老哥，你這是覺得北京守不住了麼？」
「芝泉可有什麼法子守住北京？」王士珍平靜的反問道。
或許是因為被人民黨俘虜過，段祺瑞反倒沒有王士珍想的那麼激動，「我們和人民黨打了這麼多仗，老哥你可是陸軍部大臣。」
王士珍冷笑一聲，他瞅著袁世凱府邸外，「現在守在外面的是袁克文的模範團，這小子根本不覺得大總統乃是北洋的大總統，他就覺得大總統是他袁家的人。徐總理敢讓他弟弟做這個醫生，大總統竟然不信。袁家寧肯大吵大鬧都不能決定怎麼治病。這是什麼樣子？」
段祺瑞用帶著極大惡意的目光看向袁府外面的那些模範團的軍人，停了半晌，他惡狠狠的說道：「老哥，既然大總統身體不適，袁家的人也不讓咱們護送大總統走。那咱們就突圍吧。軍都陘在咱們手中，咱們帶著隊伍去山西。徐樹錚現在在內外蒙駐紮，陝西當下也是咱們的人。只要命邢台與邯鄲的部隊不回北京，直接去山西。咱們佔據西北，肯定有東山再起的時候。」
王士珍略帶欣慰的看著段祺瑞，這是北洋軍能夠採取的最好選擇了。段祺瑞這個老弟做人功利，權力慾很重，而且出了解決不了的大事就來麻煩王士珍給想辦法，經常讓王士珍感到很不耐煩。不過以軍事修養而言，他在北洋裡面的確是出類拔萃的人物。這一段段祺瑞不在陸軍部的日子裡面，陸軍部也多次討論過局面，各種死守、或者偷襲的計劃層出不窮。可能夠果斷根據當下局面制定戰略轉移的一個都沒有。
不過這欣慰中，王士珍卻想起了另外一件事，段祺瑞到底是從什麼時候開始制定這個計劃的呢？
「那糧食的事情芝泉準備怎麼辦？」王士珍問。
聽了王士珍的問題，段祺瑞大喜，「老哥，你和我一起走。你老哥指到哪裡，我就打到哪裡。有老哥你在，這糧食的事情定然沒問題，我們北洋的兄弟也有了主心骨。」
這是每次遇到重大難題的時候段祺瑞都會掛在嘴上的話，儘管段祺瑞的心意極為誠懇，而且的確做到了他所說的。不過對每每要殫精竭慮解決問題的王士珍，這被人信賴，不得不承擔原本根本不是王士珍份內工作的事情絕對不會讓他感覺良好。
「芝泉，你走吧。哥哥我老了，這北京就是我的葬身之地。」王士珍淡淡的答道，他舉起手阻止了段祺瑞試圖勸說的打算，「這北京已經如此局面，你若帶兵走了之後更是大亂。承蒙諸家兄弟看得起我，所以我更不能走。若是不能給人民黨留下一個基本不亂的局面，天知道陳克會怎麼拿留在北京的兄弟撒氣。」
很明顯，段祺瑞並不贊同王士珍的想法，他說道：「老哥，北京大亂的話，人民黨收拾殘局也得花上不少時間。這對我們有利啊！」
「若是別的城市倒也罷了，這北京若是大亂那就不是一般的亂子。人民黨若是乾脆讓北京繼續亂，他們出兵追擊，你們卻也不好辦。反倒是北京不亂，人民黨為了面子問題，反倒不會追擊。更別說各國公使館都在北京，他們一來懼怕北京的外國駐軍動手，二來又不想讓外國公使們看不起他們，定然要留下大軍駐守北京。你們往山西撤也容易些。」
聽了王士珍的解釋，段祺瑞沉默下來。他最想得到的就是英國的支持，如果把北京徹底搞亂，段祺瑞會給英國人留下什麼印象？加入有一天他能夠東山再起，那時候想得到英國人支持的時候不免就太難。
想到這裡，段祺瑞和往常一樣感到茅塞頓開。王士珍總是能夠讓做事不免有些莽撞的段祺瑞看到最合適的選擇。「老哥，您還是跟我一起走吧。咱們北洋軍缺不了您啊！」
王士珍微微搖搖頭，「芝泉，我還是那句話，北京就是我的葬身之地，我哪裡都不去了。哥哥我今年已經64歲，沒幾天好活。這把老骨頭撂在北京，好歹能夠護上點北洋的兄弟。芝泉你今年才50歲，還是能打的時候。北洋這百萬兄弟跟著你走，就得全靠你了。而且我已經開始調集糧食的事情，可是這些糧食最多能讓北洋軍撤到山西去。我必須留在北京拖住人民黨。」
段祺瑞每次遇到大事辦不下來，都會去求王士珍。所以聽了王士珍的語氣，段祺瑞就知道這次無論如何都勸不了王士珍改變主意。而且有王士珍在北京主持局面，段祺瑞倒也真的感覺到放心。
決定了想法之後，段祺瑞又瞅了瞅袁世凱的府邸，這才轉回頭來看著王士珍，「這等事只怕還得大總統下決定才行。」
王士珍平靜的答道：「打仗是陸軍部負責，當下既然大總統不能理事，我就先把這個事情承擔起來。若是大總統能夠康復，我自然會向大總統說明此時。」
段祺瑞自然明白，王士珍這是把所有責任都給承擔起來了。若是沒有王士珍從中主持大局，單靠段祺瑞也頂多能夠拉走他自己的親信。現在有王士珍的幫助，大部分軍隊都會聽從命令。
「那這些文官都帶誰走？」既然王士珍堅決不肯走，段祺瑞就是西撤北洋軍的總指揮。他並不想讓文官做到自己頭上。不過若是沒有文官充門面，單憑段祺瑞一個人也缺乏足夠的號召力。
這話音方落，卻見到袁府門口停下了一輛馬車，徐世昌從上面下來。不過守衛袁府的人竟然不讓徐世昌進去探望。徐世昌在門口與袁家人交涉了一陣，最後居然悻悻的回到馬車上離開了。
段祺瑞與王士珍對望了一眼，文官的人選也只有現在的總理徐世昌。不過段祺瑞有些擔心，徐世昌在東北擁有極大影響力，徐世昌未必不同意現在就撤退，但是徐世昌希望最終撤到哪裡卻不好說。
不過這個問題也沒有太多可以討論的，當下京張鐵路已經被人民黨截斷，能夠撤退的方向除了山西之外根本沒有其他選擇。
「那老哥，撤軍的時間放到什麼時候。」段祺瑞問道。
「越快越好。大總統若是不在了，咱們還待在北京城裡頭。甚至不用外頭的人民黨攻城，咱們自己人只怕就先得大亂起來。」說到這裡，一直還算是頗為鎮定的王士珍終於忍不住歎了口氣。北洋完全是袁世凱一手捏起來的，不管是誰接掌了政權，都不可能讓大部分人都服氣。人民黨可不會讓北洋留下內部整頓的時間。這次人民黨幾乎是孤注一擲的猛衝到北京城下，看似冒著極大的風險，可是偏偏抓住了袁世凱病倒的機會。
王士珍並不迷信，可是他也忍不住懷疑難道冥冥中有天意在操縱此事？
段祺瑞是個極為果斷的人，眼下局面到了如此地步，萬一袁世凱病故了，再想走也走不了。更別說段祺瑞看到了一個機會，段祺瑞自己能夠登上北洋領袖的機會。這個機會幾乎是稍縱即逝，不用說別的，哪怕是袁世凱死後北洋再撤退，段祺瑞想執掌統領大權就是千難萬難的事情。也只有現在，段祺瑞可以挑選自己的人，並且帶走大部分北洋軍以及現在能夠帶走的錢財。
發揮出剛毅果斷的手腕，段祺瑞在王士珍的協助下以瘋狂的速度整頓了現在北京城內段祺瑞派系的幹部官員，第一軍軍長是段祺瑞妻弟吳光新，對於第一軍段祺瑞自然是極為放心的。
1915年8月11日上午，第一軍兩個師以鎮壓城內亂黨為名，接管了國庫、銀行的防衛。然後部隊將能夠搬運的黃金白銀統統裝走。
12日，第一軍以人民黨進攻昌平軍都陘為理由，攜帶了大量裝備彈藥以及糧食進軍昌平，並且開始秘密向山西進軍。路錦第二軍的殘部以及警察被命令接掌了北京城防。
1913年8月13日凌晨二時，袁世凱從昏迷中最後一次醒來。此時就連袁家的人也明白袁世凱這是迴光返照。袁世凱簡單的詢問了一下局面，就命令守護在身邊的家人將北洋大臣們都給請來。在一眾臉色蒼白的北洋大臣的包圍下。袁世凱平靜的宣佈，下一任大總統由徐世昌接任。同時命令北洋北方各部全力回援北京，南方各部努力進攻人民黨，以最大限度拖住人民黨。袁世凱還交代徐世昌，一定要盡力促成協約國出兵打擊人民黨。
說完這些之後，袁世凱很快就陷入了昏迷。到了凌晨四點，袁世凱在昏迷中停止了呼吸。
已經得到消息的段祺瑞只得到了徐世昌繼任大總統的命令之後，就放棄了帶徐世昌一起西行的打算。早晨三點，他命第一軍最後的殿後部隊拔營起寨向發山西進發。
徐世昌並沒想到王士珍與段祺瑞居然在背後搞著等把戲，等到13日下午，徐世昌才知道段祺瑞的大部隊已經離開軍都陘去了山西。大驚失色的徐世昌立刻派人以「大總統」的名義向段祺瑞發令，命第一軍全軍返回北京。他自己則風風火火的闖進了陸軍部找王士珍。
王士珍平靜的聽完了徐世昌驚怒交集的敘述兼怒罵，這才慢慢說道：「若是不去山西，我們還去哪裡？即便菊人兄把北方的北洋軍聚集起來，大家吃什麼？」
徐世昌當時就呆住了，他下意識的指著王士珍，過了老半晌才說出話來，「聘卿，你知道此事！你……，你早就知道此事！」
「菊人兄，我們北洋只能如此才能存留下去。除此之外別無他法。」王士珍冷冷的回答了這個問題。
徐世昌卻完全沒有從震驚中清醒過來，他跟出了毛病的留聲機一樣結結巴巴說道：「你早就知道此事！你……你早就知道此事！」
看著徐世昌這個或許能夠稱為北洋二號人物的「現任大總統」表現的如此失態。王士珍心中最後的負擔終於被卸下了。如果讓徐世昌真的接掌了大權，北洋肯定先要面對一場殘酷的內鬥。這樣的內鬥只有一個結果，把北洋拉入徹底覆滅的深淵。
王士珍心中徹底輕鬆下來，不管後世到底對王士珍有什麼評價，這一生效忠袁世凱，效忠北洋。對這兩個效忠對象，王士珍完全問心無愧。也不管徐世昌到底有什麼表現，王士珍站起身來大步走出了辦公室。接下來要做的事情堆積如山，他沒有時間與徐世昌浪費這寶貴的時間。
路錦第二軍的殘部數量不到三萬，加上警察部隊也不足以嚴密的防守住北京城。警察們雖然不敢大聲說什麼，他們不約而同的回想起幾年前馬匪肆虐時候，警察部隊也被派來守城。在那次守城後沒過多久，滿清就覆滅了。現在的局面比那時候更糟糕，警察部隊的竊竊私語中沒有任何對勝利抱有幻想的說法。
1915年8月13日中午12點，工農革命軍開始進攻北京城。大喇叭用洪亮的聲音向北京城內高喊著「袁世凱已經死了，北洋的兄弟們放下武器投降吧！工農革命軍優待俘虜。」空軍緊急使用的傳單都是戰士們手寫的，飄揚的紙上面寫著各種大小風格不一，但是內容完全一樣的內容，「袁世凱已經死了，北洋的兄弟們放下武器投降吧！工農革命軍優待俘虜。」
北洋軍大部分人都是第一次聽到這個消息，雖然將信將疑卻還算是頑強抵抗。到了下午四點左右，在昌平的第一軍已經跑去山西的消息終於傳到了守城部隊這裡。守城部隊的士氣徹底崩潰了。先是警察部隊撒丫子往北京城內的家裡面跑。而家在北京的士兵們也跟著開了小差。士氣的崩潰直接引發了軍事的崩潰，有些人茫然失措的跟著這些逃兵跑路。有些就傻呆呆的留在戰場上發呆。
先是南門，接著是東門和北門，工農革命軍基本沒遇到太大的抵抗就殺進了北京城。
「總統府」「總理府」「陸軍部」等要地紛紛失落。而王士珍兌現了自己的承諾，工農革命軍順利的接掌了國家大圖書館，國家博物院，國家資料館，還有皇宮的防守。一直提心吊膽的蒲觀水得到這個消息之後長長舒了口。北京城一天打不下來，可以打兩天。但是這些珍貴的資料文獻以及文物一旦被毀滅，那就真的再也挽救不回來。
到了8月14日，工農革命軍主力部隊把東交民巷以及外國駐軍地緊密包圍起來。繳獲的北洋軍守城部隊的大炮也調集在一起，黑洞洞的炮口全開，所有射擊諸元都定在外國駐軍的方位上。其他部隊則在緊張的收攏北洋敗兵，抓捕北洋官員。安撫北京百姓。
被破壞的電報線一時半會兒恢復不了，匯報由空軍緊急起飛向後方傳送。
8月15日，武漢的黨中央終於得到了這個期待已久的消息。