eva三號機……第九使徒被消滅之後，第三新東京市裡的居民們又迅速地恢復了正常的生活，這種令人難以置信的粗神經簡直會讓人覺得，哪怕是在生化末世之中，這這個城市裡的居民所變成的喪屍們依然會像生前一樣該怎麼生活還怎麼生活。
不過有那麼一小撮因為「拯救世界」這個偉大的理由而從五湖四海來到這座城市的人，他們的生活軌跡在這場戰鬥之後卻發生了極大的變化。
本來應該在暑假剛開始的一周裡參加補習的明日香在那一天之後就再也沒有去學校了，但她並不是為了偷懶出去玩耍，不再去學校的明日香反而成天都來到nerv基地裡進行訓練，而且比過去更加認真刻苦了。
本來天天都會和幾個美少女們一起回家、一起買菜、一起吃飯的楚軒在那一天之後好像一下子就忙了起來，經常一天到晚都呆在研究室裡，也開始出現了整夜整夜不回家的現象。
本來打算暑假裡好好地和新朋友們聯絡聯絡感情的真希波在那一天之後根本沒有「因私外出」過，她除了有時和面無表情的明日香、面無表情的綾波麗、更加面無表情的楚軒一起到基地裡去訓練，就一直沉迷在虛擬現實的世界裡——而且是《超級機器人大戰》之外的遊戲。
本來一直跟在黑貓身邊的綾波麗在那一天之後再次變成了孤單一人，她承擔起了原本黑貓一直在做的事情，利用黑貓傳授給她的「獨門秘籍」挑選美味的蔬菜、製作可口的料理，明日香、真希波和楚軒的一日三餐都是由她在照料——也許只有她的生活還和過去一樣。
而在那一天之後，本來已經成為戰鬥主力的碇真嗣真的不肯再駕駛初號機了，而且他還拒絕再參加訓練，可是碇源堂司令那邊卻始終沒有任何反應。
不過碇真嗣很快就知道為什麼父親敢對他說「無所謂了」，因為——
大概是因為聽說了三號機在啟動實驗時又發生了爆炸，而且還變成了第九使徒，eva六號機和八號機在那一天之後很快就被送到了nerv本部來。
看來。許多人都已經對eva的安全性產生了懷疑，又或許他們也清楚在理論上eva機體是沒有任何危險性的，可是這種機體總是出這樣那樣的意外，卻也難免不被人懷疑是「瘟神」機體或被詛咒的機體。
雖然這是迷信，但這迷信在各個軍事組織之中還是很有市場的，就連新人類那邊的軍隊裡，賣得最火的一本書也是《軍中禁語大全》，其中以詳實的數據和實例告訴了大家「禁語」的可怕威力。
「等這場戰爭結束後，我就要回老家結婚了」，「這件東西在我回來之前就替我保管吧」。「這裡就交給我了。你們先走」。「對方只有一個人，大家一起上啊」，「就憑你們幾個是無法打敗我的」，「不需要大人出手。這裡就交給我吧」，「等一切都結束後，我有些話想對你說」……
像這些看似沒什麼問題的話語在軍中的致死率卻意外地高，已經高到無法讓人相信這只是「巧合」的地步了。
雖然人們還不清楚為什麼有些人說話時百無禁忌，卻也能闖過一道道生死關口，最後功成名就；但大家都知道，如果說出這話的人不成功的話，那麼就必定會成仁。
或許，黑貓也是因為……
「真嗣。這是今天和兩台eva一起到來的第六適格者渚薰，以後他就住在我們家裡，八號機將由之前到來的真希波駕駛。」
傍晚時分從基地歸回的葛城美裡語氣溫和地對已經為她和渚薰做好了飯的碇真嗣介紹了新的同居者，碇真嗣拒絕駕駛eva也拒絕訓練，成天宅在家裡這件事並沒有成為她和碇真嗣之間的矛盾。
可能葛城美裡很清楚碇真嗣這次是認真的。可能葛城美裡其實也暗自對上級的決定不滿，也可能只是因為她覺得現在能動用的eva已經足夠打敗任何種類的使徒了，根本不差初號機這一台。
「你好，我是碇真嗣，暫時不再駕駛eva了。」
碇真嗣語氣溫和地朝正在對著他微笑的渚薰打了個招呼，表情略微有些羞澀。
儘管他此時正在和nerv的高層冷戰，但是他卻並沒有將氣撒在別人身上，黑貓被冷凍了的悲痛情緒也沒有明顯地出現在他身上，只是讓他的眼神有些憂鬱，從這些方面來說，碇真嗣真的已經有所成長了。
「你好，我是渚薰。
你的情況我已經聽美裡小姐說過了，以後請你多多關照——而且感謝你特地為我也準備了晚飯。」
葛城美裡笑意盈盈地看著一見面就相處得十分融洽的兩人，心裡生出了欣慰的感覺，她能夠為碇真嗣做的事情不多，也只能像這樣替他找個能和他說說話的同齡夥伴了。
另外楚軒大校現在……應該也沒什麼心情去照顧新的適格者了，所以渚薰的事情她也不得不主動挑起來。
晚上，住到了葛城美裡家最後一個房間的渚薰偷偷地溜進了碇真嗣的房間裡，打算和他開個「臥談會」，碇真嗣雖然覺得相當不習慣，但是在野營的時候他也曾經與楚軒共同睡在一個帳篷裡，所以他也沒有拒絕渚薰的熱情。
「真嗣，你為什麼不再駕駛eva了呢？能和我說說嗎？」
仰面躺在碇真嗣身邊的渚薰雙手枕在腦後，開門見山地說問出了這個相當敏感的問題，但他的溫柔語氣卻讓他的行為顯得並不怎麼突兀。
「……」
也許因為對總是溫柔地微笑著的渚薰的第一印象很好，背對著渚薰躺在鋪了薄褥的榻榻米上的碇真嗣沉默了一會兒，然後對他說起了黑貓的事、eva駕駛員間的事情、學校的事情，還有楚軒的事情。
「……所以說，我無論如何也不能理解，為什麼楚軒他的反應會那麼冷淡，那可不是別人，而是黑貓啊！
那些大人我真是受夠了！在他們眼中，我們這些駕駛員只是不過是用來消滅使徒的道具吧！」
「可是啊……真嗣，冷凍第四適格者這樣的決定，可不是nerv的司令有權做出的哦？」
渚薰一直耐心地聽碇真嗣發洩了心裡面的怨念，然後才試探性地指出了他可能「沒有注意到」的真相。
「我知道，但是都一樣！
不管是誰決定的，在他們撤消這個決定之前，我都不會再駕駛eva了——反正也不差我這一個吧！」
碇真嗣的語氣非常堅定，看來他並非只是因為一時衝動才做出了甩手不幹的決定，但他最後的語氣多少還是帶著點吃醋的感覺的——畢竟nerv這麼快就找到了他的「替代者」了嘛。
「不不不，接下來的戰鬥沒有你是不行的。
如果沒有你的話，世界真的很可能會滅亡。」
不知道為什麼，渚薰好像對碇真嗣評價很高的樣子，但他的話卻透露出了一點古怪，簡直就好像他知道接下來的戰鬥中會發生些什麼似的。
「就算世界要因此而完蛋，那麼乾脆大家一起完蛋算了，反正這種世界……」
情緒仍然十分激動的碇真嗣恨恨地回答道，肆無忌憚地發洩著自己心中的不滿。
憤怒的確給了他反抗父親，反抗nerv和seele高層的勇氣，但卻也讓他多少失去了些冷靜，使他無法察覺到渚薰話中的異常之處。
「是嗎……
好吧，我知道了。」
大概是知道自己已經無法改變碇真嗣的決定了，渚薰立即結束了這個話題，轉而向他詢問起了那個在《超級機器人大戰》裡赫赫有名的楚軒大校的事情。