雖然團勇們仍然在挨門挨戶地搜索，但紫雲山一役顯然已經進入尾聲。
擊斃大寨主龍王爺的，自然又是秦王朱由檢。前些日從地震廢墟中重新尋回了那支燧發手槍，讓他如獲至寶，這可是他的保命利器！好在手槍本身並沒受什麼損傷，朱由檢便從賀人龍處買來的火藥箱中，重新裝配了足夠的火藥。
至於彈丸，就用普通的鐵珠。由於手下沒有懂得製作彈丸的工匠，朱由檢只得採用笨辦法。他先讓鐵匠將鍛好的鐵分成小塊，再一小塊一小塊地打磨。
這方法極為耗時耗力，幾個鐵匠忙活了整整一天，才制得了幾十發彈丸，而且打磨得還不是特別圓潤，只能湊合著使用。
儘管如此，手槍近距離射擊的威力，還是人的**無法承受的。朱由檢這一槍正轟在龍王爺光溜溜的背上，當即將他的幾根肋骨擊得粉碎，並且傷及內臟。龍王爺雖有一身武藝，卻不是刀槍不入的妖魔鬼怪，也只好心不甘情不願地一翻白眼，至森羅殿報到去了。
本來大部分土匪就中了砒霜巨毒，即使不死也奄奄一息。大寨主龍王爺一死，眾匪就更是群龍無首，哪還有心抵抗，紛紛奪路而逃，企圖衝下山去。
可此時，地形這把雙刃劍終於顯示出它的威力。紫雲山三面都是懸崖峭壁，固然是易守難攻。可若攻方斷絕下山的道路，上面的人想要下去，也是極為困難。
此時民團已經攻佔了寨門，豈容土匪逃脫。團練解勇和眾頭目在此重兵把守，將推倒的寨門重新立起鎖死，人則是站在寨門外面，用幾十桿長槍封死去路。
土匪一來，還得先攀爬寨門，往往還沒爬到頂部，即被長槍戳得滿身窟窿。不一會兒，寨門內就堆滿了土匪的死屍，而團勇們則是毫髮無傷。
不多時，朱由檢和李定國也消滅了殘存在寨中的其他土匪，與解勇等人內外夾攻，終於將最後幾十名悍匪在寨門附近徹底殲滅。
「勝了！我們又勝了！！！」團勇們的歡呼聲響徹山谷，這可是民團成立以來的第一場硬仗！
朱由檢馬上下令清理戰場，救治傷員。
所謂清理戰場，其實就是看看還有沒有喘氣的土匪。如果有，就毫不客氣地補上一刀。經過清點，此役連紫雲山大寨主龍王爺在內，共斬殺土匪二百六十六人，毒殺五十七人，生俘二十五人。山上的土匪一個都沒跑了，被徹底地連鍋端了。
而民團方面，也第一次付出了一定的傷亡。其中李定國率領的突擊隊員共陣亡四人，輕傷二人；朱由檢率領的大隊人馬陣亡一人，重傷三人，輕傷十餘人；而解勇帶領的斷後部隊，則是實現了零傷亡。
雖然與土匪相比，民團的傷亡情況微乎其微，可朱由檢的心頭還是感到一陣沉重。雖說打仗肯定會死人，但眼睜睜地看著戰友死去，誰的心裡也不好受。尤其是陣亡者的兄弟，更是伏在遺體上大放悲聲。
因此朱由檢鄭重宣佈，所有戰死的團勇，遺體都要運回秦王莊隆重安葬，並且給予每人一白兩銀子的高額撫恤金。錢雖然不能讓死人復生，但對他的家庭卻是實實在在的撫慰。因為這一百兩銀子對普通家庭來說，已經是一筆巨款，足可支撐十幾年的花銷了。
至於那些土匪的屍體，朱由檢對他們就沒那麼客氣了。由於天氣漸漸炎熱，屍體腐爛會很快，容易引發疾病的傳播。因此朱由檢一聲令下，眾團勇便將這些屍體聚攏在一起，堆起乾柴，澆上菜油，再用火折子引燃。
這就是所謂「**」，那火焰登時沖天而起，將數百名土匪的屍體無情地吞噬。刺鼻的氣味瞬間瀰漫開來，多日以後才逐漸散去。
處理完死的，就該處理活的了。民團這方面的傷員，自是得到了妥善救治，重傷員還得到了二十兩銀子的救助金。
而那些俘虜的土匪，基本上都是山寨中的最末流，殺人放火這些勾當倒沒怎麼沾過邊。因此朱由檢對他們並沒有斬盡殺絕，而是將他們牢牢地綁起雙手，再用繩子串成一串，準備押解回秦王莊慢慢審問，並讓他們互相揭發。
如果確實沒有過多作惡，朱由檢打算先罰他們做一段時間的苦工，然後就恢復自由。畢竟像這樣因活不下去而落草為寇的人還很多，真正應該對這種局面負責的是，不是他們，而是**的朝廷。如果能讓他們有活路，這些人還是能成為有用之人的。
除了這些土匪，山寨上還關押了一百多名女子。這些女子都是從附近的村子中搶來的，在山寨中被迫淪為性奴，過著暗無天日的生活。
朱由檢將她們集合在一起，先是宣佈已將禍害她們的土匪斬盡殺絕，為她們報了仇。又給每人分發了五兩銀子，如果願意回家的，現在就可以馬上回去。
但很多女子都已是家破人亡，無家可歸，又覺得**於賊，沒臉回原來住的村子。朱由檢瞭解到這種情況，也暗暗歎了口氣，心想無論是哪朝哪代，無辜的弱女子都是戰亂的犧牲品。她們明明是受害者，卻還要承受世人鄙夷的眼光，真是豈有此理！
因此他又宣佈，凡是無處可去的女子，皆可以跟隨民團返回秦王莊。所有團勇在此期間，嚴禁與女子搭訕，更不得打聽對方的姓名。
待到秦王莊後，再由蕊兒做出統一安排，開始嶄新的生活，用時間撫平這段噩夢般的經歷造成的傷痛。至於以後嫁人生子，也是題中之義，總之她們又可以重新過上正常人的生活了。
這些女子感動得淚水漣漣，皆跪地哭拜。倒把朱由檢弄得老大不好意思，趕緊勸道：「起來，都起來吧！都是高興的事，就別一個勁地對著我哭了，不知道的還以為我要嚥氣呢！」
眾女子均被朱由檢逗得破涕為笑，這才止住悲聲。
除了這些女子之外，朱由檢還意外地解救出二十多名被囚禁的匠戶。原來這些匠戶也是被龍王爺擄上山的，由於有一技之長，便在土匪的嚴密看管之下，負責打造和維修兵器。
這下子朱由檢可是如獲至寶。因為秦王莊現在攤子鋪得很大，各個崗位都很缺人，但最缺的則是有技術的工匠。可以說除了燒磚的和打鐵的，其餘都是農民轉行的熟練工，真正懂技術的幾乎沒有。
尤其是至關重要的軍械，此前秦王莊是只能靠買的。而有的兵器能買到，有的卻是花錢也買不到的。朱由檢早就想建立自己的兵工廠，只是苦於沒有專業人才。
而這些匠戶的出現，對朱由檢不啻是天降大禮。因此朱由檢也不問他們願意不願意，當即宣佈將他們全帶回秦王莊。
當然朱由檢並不是土匪，他還許諾給了這些匠戶優厚的條件，包括可以在秦王莊安家落戶，配給田地，還有不菲的月銀。
這些匠戶本就十分感激朱由檢的救命之恩，聽說還給安排工作食宿，更是喜出望外。其實他們即使不被土匪擄上山寨，也快活不下去了，因此沒有一個反對的。
接下來，民團又開始清點土匪的倉庫。這一盤庫不要緊，可把朱由檢給樂壞了。原來這些土匪在紫雲山盤踞多年，很是攢下了一些家當。光是庫中存放的白銀就有五萬多兩，糧食也有數千石，還有很多布料和棉被。反正這些東西都是不義之財，朱由檢自是老實不客氣地照單全收。
而最讓他高興的，莫過於收繳了一大批武器彈藥。其中冷兵器包括單刀二百多口，長劍一百多柄，長槍一百多桿，弓箭四十多張，箭支一千多支。
除此以外，倉庫中竟還存有一百多條鳥銃，以及數十箱彈藥。尤其令朱由檢想不到的是，在倉庫角落中，還有兩門蒙著厚厚灰塵的佛郎機炮！
原來這些裝備都是龍王爺脫離官軍落草為寇時，從軍中順出來的。但他本人是騎兵出身，並不太熟悉這些火器。而他手下的那些大小嘍囉，素質就更低了，誰也不愛擺弄這些玩意，都覺得還不如刀槍用著順手。因而這些鳥銃和火炮皆被棄置不用，有很多已經生銹了。
但對朱由檢來說，現在不是東西好壞的問題，而是先要解決有沒有的問題！所以他大手一揮，將這些物資也全部納入囊中。
眾人忙了整整半日，才將全部物資從各個房間中搬出。朱由檢這才滿腔自豪地高喊道：「紫雲山一役，我們大獲全勝！現在土匪已被全部剿滅，我宣佈：班師回秦王莊，回去後論功行賞！」
眾團勇聞令均是歡聲雷動，紛紛興高采烈地挑起擔子，運送大批物資下山。
解勇和李定國等人也興奮地道：「幫主，這座山寨怎麼辦？要不要一把火燒了？」
「燒了多可惜！」朱由檢也心情極好地笑道，「留著吧，等天下太平之時，可以在這裡建個紀念館，讓子孫緬懷我們的戰績。我看這地方風景不錯，弄些賓館，搞搞旅遊開發也不錯嘛！」