中國遠征軍在遭遇日軍據守的城鎮的時候，往往直接呼叫轟炸支援，使用凝固汽油燃燒彈和新式的預制破片集束炸彈，或者白磷燃燒彈實施攻擊，直接將城鎮夷為平地，對於中國遠征軍來說，在裝甲部隊的掩護下對憑借簡陋工事抵抗的日軍實施進攻，似乎輕而易舉一般，但是實際上一旦雙方爆發慘烈無比的巷戰，中國遠征軍同樣亦傷亡巨大。%&*";
因為無論男女老幼都有背著手榴彈高呼天皇萬歲衝向中國遠征軍官兵的情況出現，這令得中國遠征軍全體官兵很有措手不及的感覺，精神時刻都處於緊張之中，相比沖繩之戰壓力更大，中國官兵向一切可疑的目標實施射擊，誤殺自然不在少數，但是戰爭已經進入了白熱化階段，日軍以陸海軍第三招募區的留守部隊組建起來的第八十二師團、第八十七師團、第九十二師團、第九十五師團、第九十七師團，戰車第三師團、戰車第四師團作為主力，意圖向東京實施反撲，激烈的戰鬥讓日軍損失巨大，1944年8月29日凌晨，日軍動員了十一個師團在內的部，包括前段時間主動出擊的第八十二師團、第八十七師團、第九十二師團、第九十五師團、第九十七師團，戰車第三師團、戰車第四師團等部隊。
第八十二師團、第八十七師團、第九十二師團、第九十五師團、第九十七師團是原來隸屬於關東軍的部隊，主力在遠東戰役期間覆滅，此番以殘部在本土重新組建起來，戰鬥力就打了折扣，加之部隊皆是三聯隊不滿編的情況，又過早的投入了反擊，在中國遠征軍的地空火力之下損失慘重。%&*";
但是，此番軍部下達了限期務必復克東京的命令，明知這是難以完成的任務，日軍參戰的部隊以國民挺身隊和奮勇隊為主體於29日凌晨從南北兩線開始對中國遠征軍實施南北對攻，為此日軍集中了最後的三百餘架作戰飛機投入的作戰，為的就是進行最後一搏，在美軍連續六個月的無差別戰略轟炸之下，日本的工業體系已經被徹底摧毀，所有武器彈藥供應也陷入了停止，很多反擊的國民挺身隊員只有一支竹槍，更多的人赤手空拳的跟在主攻部隊身後，撿拾陣亡官兵的武器繼續作戰。
菊字第五號作戰在戰後被稱為日本人的最後瘋狂，以至於之後的菊字第六號作戰徹底的胎死腹中，日軍累計在連續五日的攻擊中，投入了大約五十九萬部隊與國民挺身對於奮勇隊，其死亡率高達百分之九十，在日軍部隊出擊之前，各師團的師團長與軍司令官、參謀長紛紛剖腹自盡，以激勵部下誓死決戰，於是日軍與挺身隊、奮勇隊在內的近六十萬作戰部隊，開始部分晝夜，冒著中國遠征軍猛烈的地空火力，如同浪潮一般在長達一百五十公里的戰線上發動了一波又一波的猛攻。
可以說，橫屍遍野、堆屍如山都不如以形容日軍此戰的慘烈，中國遠征軍亦付出了超過二萬人的傷亡，很多陣地被日軍突破，防禦陣地的官兵在最後時刻呼叫向我開炮！慘烈的鏖戰進行到第五天，中國遠征軍又有二個裝甲師在內的七個整編師登陸，隨即對日軍實施反突擊，參加進攻的日軍部隊被中國遠征軍反擊部隊追擊近百公里，沿途的路邊、山崗之下、水溝、田地之間、城鎮的廢墟間，到處都是日軍與奮勇隊、挺身隊的遺屍，大量絕望的日軍傷員用僅有的手榴彈自盡，用手榴彈自盡已經是十分奢侈的行徑了，大批的日軍傷員被集中到窪地遺棄，日軍甚至連處理自己傷員的時間都沒有了。
菊字五號作戰計劃，讓日本人的菊花被徹底炸開了，實際上日軍投入的挺身隊和奮勇隊以及正規部隊總數超過八十萬人，但是由於盟軍猛烈的轟炸損失慘重，最終只有八成的部隊抵達了作戰地域，在位於北部川崎山脈餘脈的防空洞內，御前會議從9月6日一直開到8日凌晨，可以說菊字五號作戰計劃的失敗讓四十四歲的裕仁天皇已經感到了精疲力竭，雖然與會的將領們都在叫喊著一億玉碎，但是包括裕仁天皇也從同美國接觸的外交代表團傳回的消息，由於中國方面堅持嚴懲一切戰犯，包括廢除日本的天皇制在的條件，所謂的談判一直在原地踏步。
五天的交戰讓中國遠征軍集中了三百輛推土機，足足二十天還沒能掩埋全部的屍體，這讓在準備舉國玉碎的日本人頭上如同滴水成冰的冬天澆了一盆冰水，即使連婦女兒童也扛著竹槍上陣，即使像他們瘋狂宣稱的一樣死上一億人，本土決戰看來也絕不會有任何一絲勝利的希望，中國遠征軍似乎有打不完的炮彈和投不完的航空炸彈。
很多絕望之際，面對美軍大規模的戰略轟炸異常絕望的人都聚到一起，用發給他們用於襲擊中國遠征軍部隊的炸藥和手榴彈，進行集體自殺，一些日本女人甚至直接自己的孩子按在水裡淹死，失敗的氣氛瀰漫在部隊和國民之中，戰鬥下去無非是死路一條，看不到一絲一毫可以活下去的希望，每天都有大批的人在自殺。
甚至在裕仁天皇的地下工事堡壘中，在開會的三天時間裡，有六名大本營的戰術參謀舉槍自盡或者剖腹自盡的，這讓裕仁天皇徹底的心灰意冷，裕仁天皇能看得出來，中國遠征軍之所以要求嚴懲自己和廢除天皇制度，實際上是不希望日本投降，如果日本宣佈無條件投降，他們就失去了大規模屠殺的借口和理由，慘烈的交戰和美國空軍持續不斷的戰略轟炸已經讓日本損失了超過三成的人口。
對於日本人來說，這個損失是極度巨大的，尤其是菊字五號作戰計劃的失敗，導致國民與軍隊的士氣徹底總崩潰。